Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件,正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和**显示。使用包括RAxML和PAUP在内的**评审算法构建系统树,并为公开准备的图形调整显示设置。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
Geneious新功能
新的特征包括改进的火山和PCA图用于表达分析,新的CRISPR Cpf1选项和限制站点的无表型突变分析。
SnapGene文件导出
将SnapGene*.dna序列文件拖放到Geneious中,无缝地导入序列及其注释和其他元数据。
CRISPR-CPF1特异性评分
自信地选择较佳CRISPR-CPF1引导RNA位点使用新的特异性评分,这是根据对您选择的数据库的非目标分析计算出来的。
智能NGS导入
只需一个简单的步骤就可以将任何类型的SAM、BAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中,即使您有不同的样品和参考序列的混合物。
CRISPR Cpf1选项
添加了CRISPR-CPF1与5’PAM位点的支持。在A和T丰富序列中找到位点,并在体内具有更高的裂解效率。