ChromasPro如何用 互动答疑

  • 2025-01-21 15:14 8715
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ChromasPro是常用DNF序列分析软件Chromas的Pro专业版,适用于高达几兆碱基的DNA序列装配项目,以及基本的序列编辑和分析,它能够汇集来自Sanger测序仪(如ABI,454和Illumina下一代测序仪)的数据,如果有8Gb RAM可用,较多可达1,000,000个序列,ChromasPro不免费,但是可以免费试用14天。
1、Applied Biosystems .ab1,Staden Chromatogram(SCF和ZTR),454 SFF,FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank,SwissProt,GenPept,GCG RSF和纯文本格式中的笔序列。
2、以.ab1,.scf,.fasta和.fastq格式保存序列。
3、使用图形界面组合重叠序列,生成共识并**显示编辑的歧义。
4、使用质量数据自动删除低质量序列以改进序列组装。
5、使用参考序列作为装配的支架。
6、生成限制性站点和片段映射,并列出切割器,非切割器和片段。
7、在G + C框架图的帮助下绘制开放阅读框,并一键翻译ORF。
8、打印色谱图,限制性位点和片段图,以及打开阅读框架图。
9、通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
10、通过与ClustalW连接来执行多重对齐。
11、反向和补体序列和色谱图。
12、通过精确匹配或较佳比对搜索序列。
13、编辑核苷酸序列时显示翻译。
14、执行反向翻译并绘制核苷酸简并。
15、绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
16、复制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro具体功能
? 打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并**模糊性进行编辑。
? 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
? 使用参考序列作为组装的支架。
? 生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
? 映射开放阅读框,由G+C框架图辅助,并用一次点击翻译ORFs。
? 打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
? 通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
? 与ClustalW接口执行多个对齐。
? 反向互补序列和色谱图。
? 通过精确匹配或较优对齐搜索序列。
? 编辑核苷酸序列时显示翻译。
? 进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
? 绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
? 复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
系统需求
Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.
反向互补序列和色谱图。
通过精确匹配或较优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro如何用
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则较多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro如何用
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则较多可组装1,000,000个序列。


ChromasPro具体功能
? 打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并**模糊性进行编辑。
? 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
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ChromasPro如何用
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