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北京天演融智软件有限公司

漂亮的PCA图
具有更好的标签和新的可视化选项,创建漂亮的PCA图形。
对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和**显示。使用包括RAxML和PAUP在内的**评审算法构建系统树,并为公开准备的图形调整显示设置。
更好的FASTQ导入功能
在导入过程中,成对读取可以相互关联,而Geneious会猜出它们是如何配对的。还可以设置读取技术。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析


按索引连接
连接序列列表并按索引对齐,而不是按照名称对齐,这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。


序列列表的CSV/TSV导出
将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV或TSV中,这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步分析。
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NGS分析和基因组学
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分子克隆
查看质粒图,自动注释矢量并用注释复制粘贴序列。寻找限制站点、消化、连接和执行Golden Gate,Gibson和Gateway克隆。设计引物,找到CRISPR站点并优化密码。在克隆过程中跟踪历史和亲子后代谱系。


搜索、共享和自动化
针对NCBI进行批量BLAST,并直接搜索GenBank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程,以提高效率,控制业务流程,并减少您的研究中的人为错误。
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RNA-Seq表达分析的火山图
在交互式火山图中可视化基因表达,可以用来**和跳转到差异表达基因。
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序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件,正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。


对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和**显示。使用包括RAxML和PAUP在内的**评审算法构建系统树,并为公开准备的图形调整显示设置。
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为细菌基因组比对更新Mauve插件
现在包括对序列列表的支持和用于重新排序重叠群的MCM操作,使draft基因组对齐和进行基因组整理成为可能。
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SnapGene文件导出
将SnapGene*.dna序列文件拖放到Geneious中,无缝地导入序列及其注释和其他元数据。
NCBI BLAST云支持
有了NCBI BLAST云之后,设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像,Geneious可以与它连接起来。
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