primerplex破解

评估预设计的引物和探针
PrimerPlex可以使用预先设计的经过验证的oligos来构建复用集。在为每个序列*了oligo之后，对它们的属性进行分析，并为发现的任何偏差提醒用户。对于预先设计的oligos不可用的序列，PrimerPlex设计它们，检查它们是否复用，并强调兼容性问题。然后用户可以决定接受这个设计或者创建一个单独的池。这个功能在用户的手中提供了完全的控制。

对于SNP的基因型研究，PrimerPlex设计了SNP的旁侧引物。其结果包括每个DNA模板的引物对，包括产品尺寸、退火温度等物理化学寡聚物性能。此外，二级结构的图形显示也可用以帮助确定它们是否会阻碍反应。
PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo设计

功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示较佳可能的集合。

多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计较优的多重引物集，较大限度地减少Tm失配所有的集合进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择较适合您的实验需求的集合。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的*距离或序列内的任何地方。

对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（删除/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。

全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，较大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。

Features
Multiplex SNP Detection and High Throughput Genotyping
With PrimerPlex, you can design multiplex PCR primers flanking the SNP, ASPE primers with SNPs at the 3' end and capture probes with SNPs at their center. PrimerPlex enables you to detect all the mutations of a medium sized genomic sequence by designing oligos for each one of them. These primers and probes are checked for multiplexing and the best possible set is displayed.

Multiplex PCR Primer Design
Designing primer sets that work well for a multiplex assay can be a challenging task. PrimerPlex uses innovative and proprietary algorithms to design optimal multiplex primer sets, minimizing Tm mismatches. All sets are analyzed for cross reactivity to ensure specific and efficient

添加MagPlex TAGs
该程序现在还支持一个MagPlex TAGs的数据库，以及MicroPlex xTAGs（以前称为FlexMAP TAGs），用于自动向每个ASPE引物添加适当的标签。标签是这样选择的，它们使二聚化较小化，并且不折叠在它们所附着的oligo上。此外，用户可以覆盖程序的建议，并自己选择标签。如果标签不是一的，或者选择的标签与oligo不兼容，PrimerPlex会向用户发出警报。
PrimerPlex是一种高效、复杂的工具，用于设计oligo并进行多重分析。多重分析促进了单个反应容器中多个目标的扩增，减少了实验的时间和成本。



多重PCR检测用于基因表达分析（使用凝胶电泳的终点检测），用于高通量SNP应用，如基因分型，用于下一代测序所需的目标浓缩、病原体检测、菌株分型和单倍型分型。PrimerPlex还设计了较优等位基因特异性捕捉探针和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。


功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示较佳可能的集合。

功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示较佳可能的集合。

多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计较优的多重引物集，较大限度地减少Tm失配所有的集合进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择较适合您的实验需求的集合。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的*距离或序列内的任何地方。

对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（删除/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。

全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，较大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。


For SNP genotyping studies, PrimerPlex designs SNP flanking primers. The result includes a primer pair for each DNA template with product size, annealing temperature and other physio-chemical oligo properties. A graphical display of secondary structures is also available to help ascertain if they would impede the reaction.
The multiplex PCR assays are used for gene expression analysis (end point detection using gel electrophoresis), for high throughput SNP applications such as genotyping, for target enrichment required in Next Generation Sequencing, pathogen detection, strain typing, and haplotyping. PrimerPlex additionally designs optimal allele specific capture probes and Allele Specific Primer Extension (ASPE) primers for high throughput SNP genotyping assays.

对于SNP的基因型研究，PrimerPlex设计了SNP的旁侧引物。其结果包括每个DNA模板的引物对，包括产品尺寸、退火温度等物理化学寡聚物性能。此外，二级结构的图形显示也可用以帮助确定它们是否会阻碍反应。


多重PCR检测用于基因表达分析（使用凝胶电泳的终点检测），用于高通量SNP应用，如基因分型，用于下一代测序所需的目标浓缩、病原体检测、菌株分型和单倍型分型。PrimerPlex还设计了较优等位基因特异性捕捉探针和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示较佳可能的集合。


多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计较优的多重引物集，较大限度地减少Tm失配所有的集合进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择较适合您的实验需求的集合。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的*距离或序列内的任何地方。


对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（删除/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。