geneious软件安装 互动答疑 Biomatters

北京天演融智软件有限公司

Geneious 分子生物学和NGS分析软件


NGS分析和基因组学
使用行业领先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析，包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。


序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件，正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。


对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和突出显示。使用包括RAxML和PAUP在内的同行评审算法构建系统树，并为公开准备的图形调整显示设置。
NCBI BLAST云支持
有了NCBI BLAST云之后，设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像，Geneious可以与它连接起来。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业领先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析，包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析


创建酶制剂
不再从其他来源获取信息。现在您可以很容易地创建您自己的酶组。


更好的FASTQ导入功能
在导入过程中，成对读取可以相互关联，而Geneious会猜出它们是如何配对的。还可以设置读取技术。


为细菌基因组比对更新Mauve插件
现在包括对序列列表的支持和用于重新排序重叠群的MCM操作，使draft基因组对齐和进行基因组整理成为可能。


更好的BLAST服务器管理
一次设置多个BLAST服务器镜像，每次搜索时，选择最好的一个。不用每次切换镜像。


NCBI BLAST云支持
有了NCBI BLAST云之后，设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像，Geneious可以与它连接起来。

智能NGS导入
只需一个简单的步骤就可以将任何类型的SAM、BAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中，即使您有不同的样品和参考序列的混合物。
序列列表的CSV/TSV导出
将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV或TSV中，这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步分析。
搜索、共享和自动化
针对NCBI进行批量BLAST，并直接搜索GenBank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程，以提高效率，控制业务流程，并减少您的研究中的人为错误。

按索引连接
连接序列列表并按索引对齐，而不是按照名称对齐，这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。

创建酶制剂
不再从其他来源获取信息。现在您可以很容易地创建您自己的酶组。
Geneious新功能
新的特征包括改进的火山和PCA图用于表达分析，新的CRISPR Cpf1选项和限制站点的无表型突变分析。