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北京天演融智软件有限公司

序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库，从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中，以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列)，以便于传输到其他程序。

质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave，电荷- Bull&Breese指数，HPLC指数，pI，电荷)，并可以进一步工作(如交联，新的分裂)。

生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分，但是在以前的版本中，您必须自己安装。
序列窗口
序列窗口是GPMAW的核心窗口并默认显示一个序列。从这里，您可以调用大多数与序列相关的函数（通过菜单、工具栏或弹出菜单）。

Sequence handling: Import of sequences from a number of different formats with direct database search in Entrez and in local databases (FastA format and Swiss-Prot). Sequences can be saved in local files (databases) for future reference.
From the sequence window a large number of actions can be performed. Sequences can be exported in FastA format (either singly or all sequences at once) for easy transfer to other programs.
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等

通过**显示部分序列，您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航，您可以使用特定颜色的残留物（提供三种不同颜色和下划线）。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。

序列窗口形成父窗口，从中可以创建大量派生子窗口：
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表：疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮

肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是，也有其他方法，如手动或半自动分裂。

Sequence window
The sequence window is the central window of GPMAW and default view of a sequence. From here you can call most of other sequence related functions (either through the menu, the toolbar, or the pop-up menu).




序列窗口形成父窗口，从中可以创建大量派生子窗口：
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表：疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮

肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是，也有其他方法，如手动或半自动分裂。


以及精美的图片都可以轻松完成。

以上显示的，可以有多种配置方式：
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等

通过**显示部分序列，您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航，您可以使用特定颜色的残留物（提供三种不同颜色和下划线）。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。

质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave，电荷- Bull&Breese指数，HPLC指数，pI，电荷)，并可以进一步工作(如交联，新的分裂)。

生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分，但是在以前的版本中，您必须自己安装。

The GPMAW program is primarily intended as a tool for mass spectrometric analysis of proteins and peptides. However, a number of other bioinformatics tools have been included, so the use of the program extends far beyond simple mass analysis.

生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分，但是在以前的版本中，您必须自己安装。

序列窗口
序列窗口是GPMAW的核心窗口并默认显示一个序列。从这里，您可以调用大多数与序列相关的函数（通过菜单、工具栏或弹出菜单）。


当前的局限
如果修改了带电残留物，则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并*pka值，则计算“正确”。如果一个界点被修改，它仍然会产生π/电荷。

程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供，手册可以在网站下载。

位置
高效液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等


除了ms/ms搜索，该程序不需要强大的处理器或快速硬盘，可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕，或者您可以在上网本上运行它。

程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供，手册可以在网站下载。