Chemcraft安装教程

创建动画效果
Chemcraft的Windows版本可以保存多个位图文件或动画GIF文件形式的分子动画图片。下面的动画类型提供：分子旋转的动画、振动频率和PES扫描的动画。


Ÿ 修改分子中的任何几何参数（距离、角度、二面角）。该修饰可以伴随着一个原子、两个原子或选定的原子群的位移；
Ÿ 用鼠标在分子图像上拖曳原子或碎片或旋转碎片的可能性（图5）；
Ÿ 应用任意几何参数集合的迭代算法（图6）；
Ÿ 一种易于使用的实用程序，用于将点群应用于分子（图8）。

Chemcraft提供了输出文件以结构化的形式呈现。被读取的文件被分成单独的元素，例如单独的几何形状或振动模式。对于每个元素，从文件中提取所有可用数据：原子坐标、能量梯度等。所有元素都呈现在分层列表中（图1）。单击列表中的元素自动显示图像上的单独几何或模式，并允许显示不同的属性。该接口提供了计算数据的可靠可视化，包括非标准类型的计算、不完整的计算等。它还允许具有多个计算任务的复杂文件被可视化。对于能量扫描或IRC计算，通过扫描/IRC步骤将所有几何结构分成组。除了图形的数据表示之外，Chemcraft概述了输出文件的较基本部分，并为文件的每个元素显示了一个简短的“摘要”。


偶较矩可视为指针；
MO能量可以以数字形式显示。

Chencraft支持一组用于构造分子结构的工具，这些工具可用于准备计算或其他目的的初始猜测：
Ÿ 从标准分子片段（自由基等）中构建分子，提供了通过自定义剪贴板来补充该片段集并通过剪贴板复制/粘贴单个片段的可能性；


“拖曳”原子或沿键旋转碎片的例子
当“拖动”原子或执行其他结构修改时，任何几何参数都可以控制在图像上（见图5）。Chemcraft的界面允许人们轻松地改变任何原子的类型或插入/移除一个键。Chemcraft提供了快速获取Z矩阵的实用工具。Z矩阵是通过点击分子中的原子并*一些附加信息来建立的（图7）。在使用这个工具之前，首先应该在Cartesian坐标中获得分子的结构。所有用于构建分子的上述工具都可用于此目的。
应用一组*的几何参数
Z矩阵的可视化构造
Chemcraft可以调节分子中的原子坐标以应用特定的对称性（图8）。这个工具在研究中非常有用，因为对称分子比非对称分子计算得更快。
Chemcraft supports an interface for quick creation of sections of GAMESS-US input files with non-standard basis sets (fig. 4). The basis sets are extracted from their descriptions, which can be obtained at PNNL's webpage /forms/basisform.html). They can be also supplemented with additional gaussians specified by the user.