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功能多样性
功能多样性分析了样本单元X物种矩阵与物种X性状矩阵的组合。功能多样性度量试图描述样本单元中所代表的物种功能性状的多样性,而是简单的物种多样性。例如,一个包含三个物种的情节,都具有相同的特征,被认为比单一物种更多样化。同样,两个具有非常不同功能性状的物种比其功能性状相似的两个物种具有更多的功能多样性。例如,如果一个图中有两个物种,一个是杂草丛生喜欢太阳的成员植物物种,另一种是耐荫能力较差的物种,这个图形比两个不同的物种都具有更多的功能多样性,它们都说耐荫性差的植物。
PC-ORD对电子表格中的生态数据进行多变量分析。PC-ORD的重点是非参数工具、图形表示、随机化测试和自举置信区间的社区数据分析。除了用于转换数据和管理文件的实用程序之外,PC-ORD还提供了许多统计数据包中不可用的排序和分类技术:CCA、DCA、指示物种分析、Mantel试验、部分Mantel试验、MRPP、PCoA、perMANOVA、RDA、双向聚类、TWINSPAN、Beals平滑、多样性指数、物种列表、许多排序叠加方法(定量、符号编码、颜色编码、网格、联合图、双情节、连续向量)、各种旋转方法、3D排序、Bray-Curtis排序、城市街区距离测量、物种面积曲线、树数据摘要、发布质量树图、自动驾驶模式的非度量多维范围(NMS或NMDS)。可以分析大型数据集。只要您计算机的内存够,大多数操作接受较多32,000行或32,000列和较多536,848,900个矩阵元素的矩阵。完整的手册包括上下文敏感的帮助系统。
新的分析方法
*四角分析
通过样本单元x物种矩阵将物种性状与环境变量联系起来的方法学问题,因为是四个基本矩阵的排列(参看Dray和Legendre(2008,Fig.1a)以及McCune和Grace(2002,Fig.2.1)的性状x环境位置),因此被称为*四角问题。*四角分析提供了这些矩阵之间的链路强度的统计测试。对于*四角分析的理论和数学的详细解释见Legendre et al.(1997),Dray和Legendre(2008),Ter Braak et al,(2002)和Dray et al.(2004)。
PC-ORD对电子表格中的生态数据进行多变量分析。PC-ORD的重点是非参数工具、图形表示、随机化测试和自举置信区间的社区数据分析。除了用于转换数据和管理文件的实用程序之外,PC-ORD还提供了许多统计数据包中不可用的排序和分类技术:CCA、DCA、指示物种分析、Mantel试验、部分Mantel试验、MRPP、PCoA、perMANOVA、RDA、双向聚类、TWINSPAN、Beals平滑、多样性指数、物种列表、许多排序叠加方法(定量、符号编码、颜色编码、网格、联合图、双情节、连续向量)、各种旋转方法、3D排序、Bray-Curtis排序、城市街区距离测量、物种面积曲线、树数据摘要、发布质量树图、自动驾驶模式的非度量多维范围(NMS或NMDS)。可以分析大型数据集。只要您计算机的内存够,大多数操作接受较多32,000行或32,000列和较多536,848,900个矩阵元素的矩阵。完整的手册包括上下文敏感的帮助系统。
改进的数据格式和管理
新性状窗口同时显示物种形状矩阵
分类变量类型中允许文本。例如,实验**的C变量由1,2,3替换,您可以把它们编码为"burned", "mowed", and control"。其结果是,分类变量不能再用于算术运算,只定义项目组。
变量类型之间的转换:
√ Categorical to Quantitative
√ Quantitative to Categorical
√ Categorical to Binary
行名称和列名称(首字母缩写)较多可以输入12个字符。
电子表格设计允许多达200万行或列。
精简导入\导出到Excel
新项目的拖放功能被重新设计,便于文件管理
点击save All保存具有共同碱基的相关新文件组
Export Project是将给定项目的所有文件和设置从一台机器移动到另一台机器的便捷方式
Modifed File | Import简单电子表格选项包括为矩阵定义特定范围的单元
紧凑格式:代码数量从较大为4位增加到较大为8位。代码名称(物种缩写)从较大8字符增加到较大12字符
单击并拖动切换矩阵
将主矩阵或*二矩阵转换为图形文件。这提供了一种使用PC-ORD以外生成坐标的简单方法。在版本6中,这个功能只作为外接程序"wk1togph"来使用
重新分类变量(数字到文本或文本到文本)
系统需求
Operating System: Windows 98, NT, ME, 2000, XP, Vista, 7, 8, and 10
80486 or higher CPU (including Pentium 4, Athlon, Celeron, etc.)
8 MB RAM (more RAM means ability to analyze larger data sets)
16 MB of available hard disk space
Multivariate Analysis of Ecological Data For Windows 98, 00, ME, NT, XP, Vista, 7, 8, and 10
PC-ORD performs multivariate analysis of ecological data entered in spreadsheets. Our emphasis is on nonparametric tools, graphical representation, randomization tests, and bootstrapped confidence intervals for analysis of community data. In addition to utilities for transforming data and managing files, PC-ORD offers many ordination and classification techniques not available in major statistical packages including: CCA, DCA, Indicator Species Analysis, Mantel tests and partial Mantel tests, MRPP, PCoA, perMANOVA, RDA, two-way clustering, TWINSPAN, Beals smoothing, diversity indices, species lists, many ordination overlay methods (quantitative, symbol-coding, color-coding, grid, joint plot, biplot, successional vector), various rotation methods, 3-D ordination graphics, Bray-Curtis ordination, city-block distance measures, species-area curves, tree data summaries, publication-quality dendrograms, and autopilot mode nonmetric multidimensional scaling (NMS or NMDS). Very large data sets can be analyzed. Most operations accept a matrix up to 32,000 rows or 32,000 columns and up to 536,848,900 matrix elements, provided that you have adequate memory in your computer. The terminology is tailored for ecologists. The full manual is included as a context-sensitive help system.