正规代理 AlleleID学习

北京天演融智软件有限公司

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AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
的实验设计
AlleleID是一款旨在解决、病原体检测或物种的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心，AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
物种分析/跨物种实验/等位基因分析
AlleleID使用ClustalW对序列进行排列，并分析保存和物种特定区域。您可以使用程序进行实时PCR引物设计（包含SYBR Green引物设计）和双标签探针设计（TaqMan probes,
TaqMan MGB and molecular beacons）。这些检测方法只用于进行菌株检测或从混合菌株中找到感兴趣的物种。为了进行交叉物种试验，AlleleID通过识别保守区域来设计通用探针。对于相关的生物体，当研究物种的基因组草图不可用时，可以使用AlleleID来研究其基因表达。这些强大的功能可以帮助解决了很多具有挑战性的难题，例如的检测、、定量以及污染物、环境等的监测。
Sophisticated Algorithms for Assay Success
Highly specific oligos are designed by avoiding regions of significant homologies found by automatically interpreting BLAST search results. Real time PCR primer & probe efficiency is enhanced by avoiding template secondary structures. "Minimal Set", one of the most innovative features in the program, helps design the fewest number of allele specific oligonucleotide primers and dual labeled probes that uniquely identify each of the desired species/strain/taxa from the mix, lowering assay costs. For taxa or cross species assays, this feature is especially useful when the group or taxa is highly dissimilar. For a partial set of pre-designed, proven set of primers, AlleleID® can design compatible primers and probes for the rest of sequences for species identification or taxa specific assays.

Real Time PCR VS Traditional PCR
Real time PCR allows for the detection of PCR product during the early phases of the reaction. This ability of measuring the reaction kinetics in the early phases of PCR provide a distinct advantage over traditional PCR detection. Traditional methods use gel electrophoresis for the detection of PCR amplification in the final phase or at end-point of the PCR reaction.

AlleleID® also offers support for designing microarray experiments for detecting alternative splicing events.

How AlleleID® Designs a Cross Species/Taxa Specific Assay
AlleleID® designs both real time PCR assays, including molecular beacons, TaqMan® probes, TaqMan® MGB, and SYBR® Green primers, and microarrays for designing a universal probe for taxa discrimination.
科学软件网主要提供以下科学软件服务：
1、软件培训服务：与国内大学合作，聘请业内人士定期组织软件培训，截止目前，已成功举办软件培训四十多期，累计学员2000余人，不仅让学员掌握了软件使用技巧，加深了软件在本职工作中的应用深度，而且也为同行业人士搭建起了沟通的桥梁；
2、软件服务：提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务；
3、解决方案咨询服务：科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务；
4、软件升级及技术支持服务：科学软件网可向用户提供软件的本地化技术支持服务，包括软件更新升级、软件故障排除、安装调试、培训等;
5、行业研讨服务：科学软件网会针对不同行业，邀请国内外以及软件厂商技术人员，不定期在国内举办大型研讨会，时刻关注前沿技术，为国内行业技术发展提供导向。