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北京天演融智软件有限公司

北京天演融智软件有限公司（科学软件网）前身是北京世纪天演科技有限公司，成立于2001年，专注为国内高校、科研院所和以研发为主的企事业单位提供科研软件和服务的国家。
Information:
Termini: Name and composition of the N- and C-termini.
Modified residues: Name, position and composition of all individually modified residues (not the ones changed globally through the mass table).
Cross-linked residues: Residues that are cross-linked, typically cysteine residues (see B-3).
Net charge: The theoretical charge of the protein at pH 2.0, 7.0 and user-selected pH (Setup).

肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量（>20）物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成（图中蓝色上标表示），改性界点、改性残渣，即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题，可以对任何列进行排序。第二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单（鼠标右键单击），您可以访问与消化（如模拟的HPLC反相色谱图）或当前所选肽（MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图）相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始，用户可以修改定义的pka值，并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值？对于修改，这是相当简单的，每当它被定义在一个序列中时，pka值被纳入pi和电荷的计算中（也就是说，当残留物通过相关的修改进行修改时）。但是，对于mass文件，您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表，因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换，请输入系统设置，在对话框的页上，您将找到以下选择：
The display can be configured in multiple ways:
1- or 3-letter display, 
average mass/monoisotopic mass, 
fixed residue width, 
sidebar with sequence information, 
display disulfide bridges, modified residues etc.

As can be seen in the sequence part of the figure, modified residues are colored (red). More

When reading back a sequence already saved in a sequence library, there is a difference between opening a library file containing a single sequence and one containing multiple sequences. If the library file contains a single sequence, it will be read into GPMAW immediately you select the file, while you will be asked to select a sequence from a list if the library file contains multiple sequences.
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