PRIMER PREMIER百科 正版软件

北京天演融智软件有限公司（科学软件网）前身是北京世纪天演科技有限公司，成立于2001年，专注为国内高校、科研院所和以研发为主的企事业单位提供科研软件和服务的国家。
标准PCR分析的引物设计
Primer Premier是设计和分析PCR引物的全面的软件。Primer Premier通过利用接近的热力学算法和的熔化温度，找到优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质，然后报告佳的序列，按顺序排列。配备了一个方便的计算器，您可以很*地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因，选择一个搜索范围，让Primer Premier为您挑选好的引物。


Primer Premier  PCR引物设计软件
自动同源性和避免模板结构
Primer Premier自动解释BLAST搜索结果，并避免那些区域设计与数据库具有显著交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示，并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构，可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠，在您的折叠温度下，程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中，二级结构形成的区域下面用横线强调，并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特，避免模板结构提高设计引物的效率。
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项，用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。
Evaluate Pre-designed Primers
Primer Premier analyzes and evaluates the properties of pre-designed primers and ranks them for you to adjudge how far the primers are from their desired target values. This feature is especially useful if you are working with published or pre-designed well proven primers. Primers with up to 5 mismatches can also be evaluated.
For a particular primer, Primer Premier can even design a compatible set. For example, for a pre-designed or published forward primer, Primer Premier can find a compatible reverse primer that meets all the design criteria.

功能特征
新改进的搜索算法
自动顺序检索
自动同源和模板结构避免
评估预先设计引物
手动引物搜索
编辑模板序列
序列浏览
生成报告
本地/桌面搜索功能选项
计算器
数据/数据库管理


Manual Primer Search
Primer Premier offers complete control over primer design in the hands of the user. Using the manual primer search option, a user can click any nucleotide on the template sequence to get primers at the location of their choice. Primer Premier designs a primer with its 3' end located at that nucleotide and analyzes its properties instantly. The length of the primer can also be increased/decreased, per user convenience. For mutagenesis and cloning, this functionality helps in getting an optimal design in an otherwise constrained region. Primer Premier enables "sliding" the primer sequence along the DNA sequence, displaying the properties in real time, enabling users to visualize the best position to locate oligos.
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