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Sequence Trimming
Automated DNA sequencers occasionally produce poor quality reads, particularly near the sequencing primer site, and toward the end of longer sequence runs. The sequences of clones from DNA libraries frequently contain vector sequence, polyA tails, or other unrelated sequence. Introns and primer sequence frequently flank the sequence of amplified exons. Unless removed by trimming, any of these artifacts will distort your sequence assembly and downstream sequence analysis.
Sequencher provides simple-to-use but powerful tools that help you trim poor quality or ambiguous data:
MUSCLE
MUSCLE[2], a multiple-sequence alignment (MSA) program, joins the Sequencher 5.1 family of plugins. It joins Clustal, making it the second MSA program in Sequencher’s DNA-Seq Tools. Boasting both speed and accuracy, it compares very favorably [3] to other multiple-sequence alignment programs.
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sanger序列
Sequencher使传统的序列装配变得*,同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库,让一切变得更简单。通过直观的控制,您可以为数据选择佳算法,包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例,可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过,帮助您定位和处理模棱两可的问题,还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测,以提高数据结果的质量。
序列编辑
Sequencher提供一个DNA序列编辑工具,您需要确保这个序列是正确的。您可以在一个序列中查看一次您的色谱数据或在正向和反向方向查看多个对齐的色谱图。
它可以快速、方便地滚动对齐的数据,或者可以使用Sequencher的选择工具来**区域的差异或低质量。
科学软件网主要提供以下科学软件服务:
1、软件培训服务:与国内大学合作,聘请业内人士定期组织软件培训,截止目前,已成功举办软件培训四十多期,累计学员2000余人,不仅让学员掌握了软件使用技巧,加深了软件在本职工作中的应用深度,而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁;
2、软件服务:提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务;
3、解决方案咨询服务:科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务;
4、软件升级及技术支持服务:科学软件网可向用户提供软件的本地化技术支持服务,包括软件更新升级、软件故障排除、安装调试、培训等;
5、行业研讨服务:科学软件网会针对不**业,邀请国内外以及软件厂商技术人员,不定期在国内举办大型研讨会,时刻关注*技术,为国内行业技术发展提供导向。