正版软件 sequencher正版软件培训班

北京天演融智软件有限公司

北京天演融智软件有限公司（科学软件网）前身是北京世纪天演科技有限公司，成立于2001年，专注为国内高校、科研院所和以研发为主的企事业单位提供科研软件和服务的国家。
Compare gene variants to a reference sequence
Confirm vector constructs
Assemble viral and bacterial genomes
Cluster tens of thousands of sequences from cDNA libraries
Assemble cDNA to genomic sequence
Create a primer map

MUSCLE
MUSCLE[2], a multiple-sequence alignment (MSA) program, joins the Sequencher 5.1 family of plugins. It joins Clustal, making it the second MSA program in Sequencher’s DNA-Seq Tools. Boasting both speed and accuracy, it compares very favorably [3] to other multiple-sequence alignment programs.
MUSCLE is said to have four major steps in its alignment process. The first step constructs a distance matrix between pairs of sequences using k-mer clustering, this is then converted into a tree. The second step uses this tree to guide a progressive alignment. In the final two steps, the MUSCLE algorithm tries a number of different methods to see if it is possible to improve the tree and hence the multiple alignment.
Once the process is complete and MUSCLE has built the alignment, you will see the results as a contig within Sequencher. Use Sequencher’s tools to annotate your alignment or export your alignment and place it into a special phylogenetics program.

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们必备的工具。持续发展和改进超过25年，Sequencher提供了无与伦比的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sanger序列
Sequencher使传统的序列装配变得容易，同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库，让一切变得更简单。通过直观的控制，您可以为数据选择佳算法，包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例，可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过，帮助您定位和处理模棱两可的问题，还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测，以提高数据结果的质量。


序列编辑
Sequencher提供一个DNA序列编辑工具，您需要确保这个序列是正确的。您可以在一个序列中查看一次您的色谱数据或在正向和反向方向查看多个对齐的色谱图。


它可以快速、方便地滚动对齐的数据，或者可以使用Sequencher的选择工具来突出区域的差异或低质量。

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们必备的工具。持续发展和改进超过25年，Sequencher提供了无与伦比的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sequencher的Reference Sequence是一个强大的功能，它控制着编号、特征以及更多的功能。与Variance Table结合一起使用，可以很容易地确定您是在看已知的还是未报告的SNPs。使用Clustal，从Sequencher的项目桌面直接对齐序列。当有来自不同来源的多个样本时，您甚至可以使用Clustal的名称。创建工作报告，来自Variance Table的PDF报告，是一个分享您的信息的好方法，保存在您的实验室笔记中或者在演示文稿中使用。自定义工作区，控制窗口的位置，并使用标签来区分序列和重叠群。使用主题和突出显示来识别序列区域。在模板中维持所有设置，以便您和您的同事可以使用相同的标准操作程序。


自定义工作区
可以自定义窗口的默认位置，Sequencher会记住您的设置格式和一致性选项。您还可以保存所有的设置，包括Reference Sequence,作为Project Template，可以重复使用，节省分析设置时间。


Ÿ 使用主题来突出您定义的子序列
Ÿ 记住会话间的标尺设置
Ÿ 为您的工作风格选择佳的窗口布局并保存它们
Ÿ 自定义项目窗口的显示
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